ГБУ ДО «ММПЦ «Машук» является организацией дополнительного образования. Филиалов в своей структуре не имеет. Органами управления Учреждения являются Совет Учреждения, директор Учреждения. В структуре учреждения в 2020 году создан центр патриотического воспитания «Авангард».
